| Amphibiens | Rana pyrenaica Serra-Cobo, 1993 | Grenouille des Pyrénées (La) |
| Angiospermes | Acis fabrei (Quézel & Girerd) Lledo, A.P.Davis & M.B.Crespo, 2004 | Nivéole de Fabre |
| Angiospermes | Acis nicaeensis (Ardoino) Lledó, A.P.Davis & M.B.Crespo, 2004 | Nivéole de Nice |
| Angiospermes | Adonis vernalis L., 1753 | Grand Oeil-de-boeuf, Adonis de printemps, Adonis printanier |
| Angiospermes | Aethionema monospermum R.Br., 1812 | Aéthionème à une graine |
| Angiospermes | Aethionema thomasianum J.Gay, 1845 | Aéthionème de Thomas |
| Angiospermes | Agropyron cristatum subsp. pectinatum (M.Bieb.) Tzvelev, 1970 | Chiendent pectiné en forme de crête |
| Angiospermes | Alkanna lutea Moris, 1845 | Henné jaune, Orcanette jaune |
| Angiospermes | Allium angulosum L., 1753 | Ail à tige anguleuse, Ail anguleux |
| Angiospermes | Allium nigrum L., 1762 | Ail noir, Ail de Chine |
| Angiospermes | Allium strictum Schrad., 1809 | Ail dressé |
| Angiospermes | Allium suaveolens Jacq., 1789 | Ail odorant |
| Angiospermes | Anacamptis morio subsp. longicornu (Poir.) H.Kretzschmar, Eccarius & H.Dietr., 2007 | Orchis à long éperon |
| Angiospermes | Anacamptis palustris (Jacq.) R.M.Bateman, Pridgeon & M.W.Chase, 1997 | Orchis des marais |
| Angiospermes | Anchusa crispa subsp. crispa Viv., 1825 | |
| Angiospermes | Anchusa crispa subsp. valincoana Paradis, Piazza & Quilichini, 2018 | |
| Angiospermes | Anchusa crispa Viv., 1825 | Buglosse crépue |
| Angiospermes | Androsace cylindrica subsp. cylindrica DC., 1805 | Androsace cylindrique |
| Angiospermes | Androsace elongata L., 1763 | Androsace allongée |
| Angiospermes | Androsace lactea L., 1753 | Androsace couleur de lait |
| Angiospermes | Anemone palmata L., 1753 | Anémone palmée |
| Angiospermes | Antinoria agrostidea (DC.) Parl., 1845 | Canche faux agrostis, Antinorie faux agrostis, Antinorie fausse-agrostide |
| Angiospermes | Antirrhinum majus subsp. tortuosum (Bosc) Ball, 1878 | Grande gueule-de-loup sinueuse, Muflier tortueux, Grand muflier tortueux |
| Angiospermes | Arabis soyeri subsp. soyeri Reut. & A.L.P.Huet, 1853 | Arabette de Soyer, Arabette de Soyer-Willemet |
| Angiospermes | Arenaria ligericina Lecoq & Lamotte, 1847 | Sabline de Lozère, Sabline de la Loire |
| Angiospermes | Aristolochia clusii Lojac., 1907 | Aristoloche de l'Escluse, Aristoloche de L'Écluse |
| Angiospermes | Armeria belgenciensis Donad. ex Kerguélen, 1987 | Armérie de Belgentier, Arméria de Belgentier |
| Angiospermes | Artemisia borealis Pall., 1776 | Armoise septentrionale |
| Angiospermes | Artemisia insipida Vill., 1779 | Armoise insipide |
| Angiospermes | Artemisia molinieri Quézel, M.Barbero & R.J.Loisel, 1966 | Armoise de Molinier |
| Angiospermes | Arundo donaciformis (Loisel.) Hardion, Verlaque & B.Vila, 2012 | Canne de Pline |
| Angiospermes | Arundo micrantha Lam., 1791 | Canne de Pline |
| Angiospermes | Asperula arvensis L., 1753 | Aspérule des champs, Petite Râpette |
| Angiospermes | Asperula capillacea (Lange) R.Vilm., 1975 | Aspérule capillaire, Aspérule à tiges capillaires |
| Angiospermes | Astragalus alopecuroides L., 1753 | Astragale queue de renard, Astragale de Narbonne, Queue-de-renard d'Espagne, Astragale fausse queue-de-renard |
| Angiospermes | Astragalus glaux L., 1753 | Astragale glaux |
| Angiospermes | Astragalus leontinus Wulfen, 1781 | Astragale de Lienz |
| Angiospermes | Astragalus tragacantha L., 1753 | Astragale de Marseille, Coussin-de-belle-mère |
| Angiospermes | Atractylis cancellata L., 1753 | Atractyle grillagé |
| Angiospermes | Bassia laniflora (S.G.Gmel.) A.J.Scott, 1978 | Bassie à fleurs duveuteuses, Kochia à fleurs laineuses, Bassia à fleurs laineuses, Bassie à fleurs laineuses |
| Angiospermes | Bellevalia trifoliata (Ten.) Kunth, 1843 | Jacinthe à trois feuilles, Bellevalia à trois feuilles |
| Angiospermes | Betula nana L., 1753 | Bouleau nain |
| Angiospermes | Biscutella rotgesii Foucaud, 1900 | Lunetière de Rotgès |
| Angiospermes | Biserrula epiglottis (L.) P.Coulot, P.Rabaute & J.-M.Tison, 2014 | Astragale épiglotte |
| Angiospermes | Brassica repanda subsp. galissieri (Giraudias) Heywood, 1964 | Chou de Galissier |
| Angiospermes | Bupleurum gerardi All., 1773 | Buplèvre de Gérard |
| Angiospermes | Calamagrostis neglecta (Ehrh.) G.Gaertn., B.Mey. & Scherb., 1799 | Calamagrostide négligée |
| Angiospermes | Campanula baumgartenii Becker, 1827 | Campanule de Baumgarten |
| Angiospermes | Campanula cervicaria L., 1753 | Cervicaire, Campanule à fleurs en tête, Campanule cervicaire |
| Angiospermes | Carex atrofusca Schkuhr, 1801 | Laîche brun-noirâtre, Laîche brûlée |
| Angiospermes | Carex chordorrhiza L.f., 1782 | Laîche à longs rhizomes |
| Angiospermes | Carex dioica L., 1753 | Laîche dioïque |
| Angiospermes | Carex fritschii Waisb., 1895 | Laîche de Fritsch |
| Angiospermes | Carex glacialis Mack., 1910 | Laîche des glaciers |
| Angiospermes | Carex heleonastes Ehrh. ex L.f., 1782 | Étoile des marais, Laîche des marais, Laîche des tourbières |
| Angiospermes | Carex hordeistichos Vill., 1779 | Laîche à épis d'orge, Laîche fausse Orge |
| Angiospermes | Carex melanostachya M.Bieb. ex Willd., 1805 | Laîche à épi noir, Laîche à épis noirs |
| Angiospermes | Carex vaginata Tausch, 1821 | Laîche à feuilles engainantes |
| Angiospermes | Carpesium cernuum L., 1753 | Carpésium penché |
| Angiospermes | Centaurea corymbosa Pourr., 1788 | Centaurée de la Clape, Centaurée en corymbe |
| Angiospermes | Centaurea jordaniana subsp. balbisiana (Soldano) Kerguélen, 1998 | Centaurée couchée, Centaurée de Balbis |
| Angiospermes | Centaurea pseudocineraria (Fiori) Rouy, 1904 | Fausse Centaurée bleuâtre |
| Angiospermes | Centaurium chloodes (Brot.) Samp., 1913 | Petite centaurée à fleurs serrées |
| Angiospermes | Centaurium favargeri Zeltner, 1970 | Petite centaurée de Favarger |
| Angiospermes | Centranthus trinervis (Viv.) Bég., 1903 | Centranthe à trois nervures |
| Angiospermes | Cicuta virosa L., 1753 | Cigüe aquatique, Ciguë vénéneuse, Cigüe vireuse |
| Angiospermes | Cistus inflatus Pourr. ex Demoly, 1998 | Ciste hirsute, Ciste hérissé |
| Angiospermes | Colchicum filifolium (Cambess.) Stef., 1926 | Mérendère à feuilles filiformes |
| Angiospermes | Coronilla securidaca L., 1753 | Sécurigéra |
| Angiospermes | Cotoneaster delphinensis Chatenier, 1923 | Cotonéaster du Dauphiné |
| Angiospermes | Crepis praemorsa (L.) Walther, 1802 | Crépide à rhizome, Crépide en rosette, Crépide rongée |
| Angiospermes | Crocus ligusticus Mariotti, 1988 | Crocus de Ligurie |
| Angiospermes | Cyperus laevigatus L., 1771 | Souchet à deux épis |
| Angiospermes | Cyperus laevigatus subsp. distachyos (All.) Maire & Weiller, 1957 | Souchet lisse |
| Angiospermes | Dactylorhiza sphagnicola (Höppner) Aver., 1984 | Orchis des sphaignes, Dactylorhize des sphaignes |
| Angiospermes | Damasonium alisma Mill., 1768 | Étoile d'eau, Damasonie étoilée |
| Angiospermes | Damasonium polyspermum Coss., 1849 | Étoile d'eau à nombreuses graines |
| Angiospermes | Daucus carota subsp. gadecaei (Rouy & E.G.Camus) Heywood, 1968 | Carotte de Gadeceau |
| Angiospermes | Delphinium ajacis L., 1753 | Dauphinelle des jardins |
| Angiospermes | Delphinium elatum L., 1753 | Pied d'alouette élevé, Dauphinelle élevée |
| Angiospermes | Delphinium elatum subsp. helveticum Pawl., 1934 | Dauphinelle de Suisse |
| Angiospermes | Draba incana L., 1753 | Drave blanchâtre, Drave de Berne |
| Angiospermes | Elatine brochonii Clavaud, 1883 | Élatine de Brochon |
| Angiospermes | Elatine hydropiper L., 1753 | Élatine poivre-d'eau |
| Angiospermes | Elatine triandra Schkuhr, 1791 | Élatine à trois étamines |
| Angiospermes | Erica erigena R.Ross, 1969 | Bruyère de l'ouest |
| Angiospermes | Erica lusitanica Rudolphi, 1800 | Bruyère du Portugal |
| Angiospermes | Erica lusitanica subsp. cantabrica | |
| Angiospermes | Erinacea anthyllis Link, 1831 | Cytise hérisson, Érinacée piquante |
| Angiospermes | Eriophorum gracile Koch ex Roth, 1806 | Linaigrette grêle |
| Angiospermes | Erodium rodiei (Braun-Blanq.) Poirion, 1964 | Érodium de Rodié, Bec-de-grue de Rodié |
| Angiospermes | Eryngium pusillum L., 1753 | Panicaut nain de Barrelier, Panicaut de Barrelier, Panicaut fluet de Barrelier |
| Angiospermes | Eryngium viviparum J.Gay, 1848 | Panicaut nain vivipare, Panicaut vivipare |
| Angiospermes | Erysimum incanum Kunze, 1846 | Vélar blanc |
| Angiospermes | Erysimum incanum subsp. aurigeranum (Jeanb. & Timb.-Lagr.) O.Bolòs & Vigo, 1990 | Vélar gris blanchâtre de l'Ariège, Vélar de l'Ariège |
| Angiospermes | Eudianthe coelirosa (L.) Rchb., 1844 | Silène Rose-du-ciel |
| Angiospermes | Euphorbia flavicoma subsp. costeana (Rouy) P.Fourn., 1936 | Euphorbe de Coste |
| Angiospermes | Euphorbia seguieriana subsp. loiseleurii (Rouy) P.Fourn., 1936 | Euphorbe de Loiseleur |
| Angiospermes | Festuca amethystina L., 1753 | Fétuque améthyste |
| Angiospermes | Filago carpetana (Lange) Chrtek & Holub, 1963 | Évax à fruits hirsutes |
| Angiospermes | Fritillaria moggridgei Baker, 1879 | Fritillaire de Moggridge |
| Angiospermes | Fritillaria montana Hoppe, 1832 | Fritillaire d'Orient |
| Angiospermes | Galium trifidum L., 1753 | Gaillet trifide |
| Angiospermes | Genista aetnensis (Biv.) DC., 1825 | Genêt de l'Etna |
| Angiospermes | Genista delphinensis Verl., 1872 | Genêt ailé du Dauphiné |
| Angiospermes | Genista horrida (Vahl) DC., 1805 | Genêt-hérisson |
| Angiospermes | Genista linifolia L., 1762 | Genêt à feuilles de lin |
| Angiospermes | Gentiana utriculosa L., 1753 | Gentiane à calice renflé, Gentianelle à calice renflé |
| Angiospermes | Geranium bohemicum L., 1756 | Géranium de Bohême |
| Angiospermes | Geranium endressii J.Gay, 1832 | Géranium d'Endress |
| Angiospermes | Geum heterocarpum Boiss., 1838 | Benoîte à fruits divers, Benoîte à fruits variables |
| Angiospermes | Gladiolus palustris Gaudin, 1828 | Glaïeul des marais |
| Angiospermes | Gymnadenia odoratissima (L.) Rich., 1817 | Gymnadenie odorante, Orchis odorant |
| Angiospermes | Hammarbya paludosa (L.) Kuntze, 1891 | Malaxis des tourbières, Malaxis à deux feuilles, Malaxide des marais, Malaxis des marais |
| Angiospermes | Helianthemum lunulatum (All.) DC., 1805 | Hélianthème à lunules |
| Angiospermes | Helichrysum arenarium (L.) Moench, 1794 | Immortelle des sables, Gnaphale des sables |
| Angiospermes | Helictotrichon cantabricum (Lag.) Gervais, 1973 | Avoine cantabrique, Avoine des Cantabriques |
| Angiospermes | Helosciadium repens (Jacq.) W.D.J.Koch, 1824 | Ache rampante |
| Angiospermes | Herminium monorchis (L.) R.Br., 1813 | Orchis musc, Herminium à un seul tubercule |
| Angiospermes | Hormathophylla pyrenaica (Lapeyr.) Dudley & Cullen, 1965 | Alysson des Pyrénées, Corbeille d'argent des Pyrénées, Alysse des Pyrénées |
| Angiospermes | Hyoseris scabra L., 1753 | Chicorée scabre, Hyoséris scabre |
| Angiospermes | Iberis intermedia subsp. beugesiaca J.-M.Tison, 2003 | |
| Angiospermes | Iberis intermedia subsp. intermedia Guers., 1803 | |
| Angiospermes | Iberis timeroyi Jord., 1847 | Ibéris de Timeroy |
| Angiospermes | Inula helenioides DC., 1815 | Inule faux-hélénium, Inule fausse-aunée |
| Angiospermes | Ipomoea sagittata Poir., 1789 | Ipomée sagittée |
| Angiospermes | Iris sibirica L., 1753 | Iris de Sibérie, Iris bleu des marais |
| Angiospermes | Iris xiphium L., 1753 | Iris à feuilles en forme de glaive, Iris d'Espagne |
| Angiospermes | Isatis alpina Vill., 1779 | Pastel des Alpes, Pastel d'Allioni |
| Angiospermes | Jacobaea uniflora (All.) Veldkamp, 2006 | Séneçon de Haller |
| Angiospermes | Jasione crispa subsp. arvernensis Tutin, 1973 | Jasione d'Auvergne |
| Angiospermes | Kadenia dubia (Schkuhr) Lavrova & V.N.Tikhom., 1986 | Sélin douteux, Sélin veiné |
| Angiospermes | Klasea lycopifolia (Vill.) Á.Löve & D.Löve, 1961 | Serratule à feuilles de Chanvre d'eau |
| Angiospermes | Kosteletzkya pentacarpos (L.) Ledeb., 1842 | Kosteletzkya à cinq fruits, Hibiscus à cinq fruits |
| Angiospermes | Lactuca quercina L., 1753 | Laitue à feuilles de chêne, Laitue de Chaix |
| Angiospermes | Laser trilobum (L.) Borkh. ex G.Gaertn., B.Mey. & Scherb., 1799 | Laser à feuilles à trois lobes |
| Angiospermes | Lathyrus palustris L., 1753 | Gesse des marais |
| Angiospermes | Leucanthemum crassifolium (Lange) Willk., 1865 | |
| Angiospermes | Leucanthemum meridionale D.Legrand, 1881 | Marguerite du Midi, Leucanthème du Midi |
| Angiospermes | Limonium bonifaciense Arrigoni & Diana, 1993 | Statice de Bonifacio |
| Angiospermes | Limonium florentinum Arrigoni & Diana, 1993 | Statice de Florence, Saladelle de Saint-Florent |
| Angiospermes | Limonium humile Mill., 1768 | Statice humble, Petit statice, Petit Limonium |
| Angiospermes | Limonium portovecchiense Erben, 2001 | Statice de Porto-Vecchio |
| Angiospermes | Limonium strictissimum (Salzm.) Arrigoni, 1990 | Statice à rameaux raides, Limonium à rameaux raides, Statice stricte |
| Angiospermes | Limonium tarcoense Arrigoni & Diana, 1993 | Saladelle de Tarco |
| Angiospermes | Linaria triphylla (L.) Mill., 1768 | Linaire à feuilles par trois |
| Angiospermes | Lindernia procumbens (Krock.) Philcox, 1965 | |
| Angiospermes | Linnaea borealis L., 1753 | Linnée boréale |
| Angiospermes | Loeflingia hispanica L., 1753 | Loeflingie d'Espagne |
| Angiospermes | Lotus tetragonolobus L., 1753 | Lotier pourpre, Lotier rouge |
| Angiospermes | Lysimachia thyrsiflora L., 1753 | Lysimaque à fleurs en épi, Lysimaque à fleurs en thyrse, Lysimaque thyrsiflore |
| Angiospermes | Lysimachia tyrrhenia (Thore) U.Manns & Anderb., 2009 | Mouron à feuilles charnues |
| Angiospermes | Lythrum thesioides M.Bieb., 1808 | Salicaire faux-thésium |
| Angiospermes | Matthiola valesiaca J.Gay ex Boiss., 1867 | Matthiole du Valais, Violier du Valais, Matthiole buissonnante du Valais |
| Angiospermes | Melica ciliata subsp. transsilvanica (Schur) Husn., 1898 | Mélique de Transylvanie |
| Angiospermes | Melilotus messanensis (L.) All., 1785 |
| Angiospermes | Micranthes hieraciifolia (Waldst. & Kit. ex Willd.) Haw., 1822 | Saxifrage à feuilles d'Épervière |
| Angiospermes | Minuartia viscosa (Schreb.) Schinz & Thell., 1907 | Minuartie visqueuse |
| Angiospermes | Moehringia lebrunii Merxm., 1965 | Sabline de Le Brun, Moehringie de Le Brun |
| Angiospermes | Myosotis speluncicola (Schott ex Boiss.) Rouy, 1881 | Myosotis des grottes |
| Angiospermes | Myriolimon diffusum (Pourr.) Lledó, Erben & M.B.Crespo, 2005 | Limonium diffus |
| Angiospermes | Nigella arvensis L., 1753 | Nigelle des champs |
| Angiospermes | Nigella nigellastrum (L.) Willk., 1880 | Garidelle fausse Nigelle |
| Angiospermes | Notobasis syriaca (L.) Cass., 1825 | Notobasis de Syrie, Chardon de Syrie, Cirse de Syrie |
| Angiospermes | Nuphar pumila (Timm) DC., 1821 | Nénuphar nain, Petit nénuphar, Nénufar nain |
| Angiospermes | Oenanthe fluviatilis (Bab.) Coleman, 1844 | Oenanthe des fleuves, Oenanthe des rivières, Oenanthe des eaux courantes |
| Angiospermes | Omphalodes linifolia (L.) Moench, 1794 | Omphalodès à feuilles de lin |
| Angiospermes | Onobrychis arenaria (Kit. ex Willd.) DC., 1825 | Sainfoin des sables, Esparcette des sables |
| Angiospermes | Onosma arenaria subsp. pyramidata Braun-Blanq., 1917 | Orcanette des sables, Orcanette jaune, Orcanette des sables en pyramide |
| Angiospermes | Onosma arenaria Waldst. & Kit., 1812 | Orcanette des sables |
| Angiospermes | Onosma tricerosperma subsp. atlantica (Braun-Blanq. ex Kerguélen) B.Bock & J.-M.Tison, 2012 | Orcanette atlantique |
| Angiospermes | Ophrys aranifera subsp. praecox (Corrias) Véla, 2008 | Ophrys précoce |
| Angiospermes | Ophrys argensonensis Guérin & Merlet, 1998 | Ophrys de l'Argenson |
| Angiospermes | Ophrys fuciflora subsp. elatior (Gumpr. ex Paulus) Engel & Quentin, 1993 | Ophrys élevé, Ophrys frelon |
| Angiospermes | Ophrys iricolor Desf., 1807 | |
| Angiospermes | Ophrys speculum Link, 1799 | Ophrys miroir |
| Angiospermes | Ophrys tenthredinifera Willd., 1805 | Ophrys tenthrède, Ophrys à grandes fleurs |
| Angiospermes | Orchis langei K.Richt., 1890 | Orchis de Lange |
| Angiospermes | Orchis pauciflora Ten., 1815 | Orchis à fleurs peu nombreuses |
| Angiospermes | Ornithogalum exscapum subsp. sandalioticum Tornad. & Garbari, 1979 | Ornithogale sans tige, Ornithogale de Sardaigne |
| Angiospermes | Paeonia mascula (L.) Mill., 1768 | Pivoine mâle |
| Angiospermes | Paeonia officinalis subsp. officinalis L., 1753 | Pivoine officinale |
| Angiospermes | Pedicularis recutita L., 1753 | Pédiculaire tronquée |
| Angiospermes | Phyteuma cordatum Balb., 1809 | Raiponce en forme de cœur |
| Angiospermes | Picris rhagadioloides (L.) Desf., 1804 | Picride très élevée, Picride fausse rhagadiole |
| Angiospermes | Pimpinella lutea Desf., 1798 | Pimpinelle jaune, Boucage jaune |
| Angiospermes | Pimpinella siifolia Leresche, 1879 | Pimpinelle à feuilles de Sium, Boucage à feuilles de berle |
| Angiospermes | Pinguicula grandiflora subsp. rosea (Mutel) Casper, 1962 | Grassette à fleurs roses |
| Angiospermes | Pinguicula reichenbachiana Schindl., 1908 | Grassette de Reichenbach |
| Angiospermes | Plantago cornutii Gouan, 1773 | Plantain de Cornut |
| Angiospermes | Polygonum romanum Jacq., 1768 | Renouée de France |
| Angiospermes | Polygonum romanum subsp. gallicum (Raffaelli) Raffaelli & L.Villar, 1988 | Renouée de France |
| Angiospermes | Potamogeton compressus L., 1753 | Potamot à tige comprimée, Potamot comprimé |
| Angiospermes | Potamogeton praelongus Wulfen, 1805 | Potamot allongé |
| Angiospermes | Potentilla multifida L., 1753 | Potentille à divisions nombreuses, Potentille multifide |
| Angiospermes | Potentilla nivea L., 1753 | Potentille blanc de neige |
| Angiospermes | Primula halleri J.F.Gmel., 1775 | Primevère de Haller |
| Angiospermes | Prunus lusitanica L., 1753 | Prunier du Portugal |
| Angiospermes | Quercus crenata Lam., 1785 | Faux chêne-liège |
| Angiospermes | Ranunculus canutii Coss. ex Ardoino, 1867 | Renoncule du mont Gargano |
| Angiospermes | Ranunculus lateriflorus DC., 1817 | Renoncule à fleurs latérales, Grande Douve |
| Angiospermes | Ranunculus lingua L., 1753 | Grande douve, Renoncule Langue |
| Angiospermes | Ranunculus rionii Lagger, 1848 | Renoncule de Rion |
| Angiospermes | Rhaponticoides alpina (L.) M.V.Agab. & Greuter, 2003 | Centaurée australe |
| Angiospermes | Rhododendron hirsutum L., 1753 | Rhododendron poilu, Rhododendron cilié |
| Angiospermes | Romulea ligustica Parl., 1858 | Romulée de Ligurie |
| Angiospermes | Rouya polygama (Desf.) Coincy, 1901 | Thapsie de Rouy |
| Angiospermes | Saponaria bellidifolia Sm., 1791 | Saponaire à feuilles de pâquerette |
| Angiospermes | Saxifraga hirculus L., 1753 | Saxifrage œil-de-bouc, Faux Ciste, Saxifrage à fleurs jaunes, Saxifrage dorée |
| Angiospermes | Saxifraga lamottei Luizet, 1913 | Saxifrage de Lamotte |
| Angiospermes | Saxifraga mutata L., 1762 | Saxifrage variable |
| Angiospermes | Saxifraga rosacea Moench, 1794 | Saxifrage trompeuse, Saxifrage rose |
| Angiospermes | Saxifraga rosacea subsp. rosacea Moench, 1794 | Saxifrage rose |
| Angiospermes | Saxifraga rosacea subsp. sponhemica (C.C.Gmel.) D.A.Webb, 1963 | Saxifrage rhénane |
| Angiospermes | Saxifraga seguieri Spreng., 1807 | Saxifrage de Séguier |
| Angiospermes | Scabiosa canescens Waldst. & Kit., 1802 | Scabieuse blanchâtre, Scabieuse odorante |
| Angiospermes | Scandix stellata Banks & Sol., 1794 | Scandix étoilé |
| Angiospermes | Scorzonera parviflora Jacq., 1776 | Scorzonère à petites fleurs |
| Angiospermes | Scutellaria hastifolia L., 1753 | Scutellaire à feuilles hastées, Scutellaire hastée |
| Angiospermes | Senecio ruthenensis Mazuc & Timb.-Lagr., 1854 | Séneçon du Rouergue, Séneçon de Rodez |
| Angiospermes | Senecio sarracenicus L., 1753 | Séneçon des cours d'eau |
| Angiospermes | Serapias nurrica Corrias, 1982 | Sérapias de la Nurra |
| Angiospermes | Sesleria ovata (Hoppe) A.Kern., 1881 | Seslérie ovale |
| Angiospermes | Silene badaroi Breistr., 1966 | Silène de Salzmann, Silène de Badaro |
| Angiospermes | Silene muscipula L., 1753 | Silène attrape-mouches |
| Angiospermes | Silene sedoides Poir., 1789 | Silène faux-orpin, Silène faux-sédum |
| Angiospermes | Silene velutina Pourr. ex Loisel., 1809 | Silène velouté |
| Angiospermes | Sinapis pubescens L., 1767 | Moutarde pubescente |
| Angiospermes | Smyrnium perfoliatum subsp. rotundifolium (Mill.) Bonnier & Layens, 1894 | Maceron à feuilles rondes |
| Angiospermes | Spergula segetalis (L.) Vill., 1789 | Spergulaire des moissons |
| Angiospermes | Spiranthes aestivalis (Poir.) Rich., 1817 | Spiranthe d'été |
| Angiospermes | Stachys brachyclada Noë ex Coss., 1854 | Épiaire à rameaux courts |
| Angiospermes | Stachys maritima Gouan, 1764 | Épiaire maritime |
| Angiospermes | Stachys ocymastrum (L.) Briq., 1893 | Épiaire hérissée |
| Angiospermes | Staphisagria macrosperma Spach, 1838 | Staphisaigre |
| Angiospermes | Staphisagria picta subsp. requienii (DC.) B.Bock, 2012 | Dauphinelle de Requien |
| Angiospermes | Stellaria palustris Ehrh. ex Hoffm., 1791 | Stellaire des marais |
| Angiospermes | Sternbergia colchiciflora Waldst. & Kit., 1805 | Stenbergie à fleurs de colchique |
| Angiospermes | Subularia aquatica L., 1753 | Subulaire aquatique |
| Angiospermes | Taraxacum bessarabicum (Hornem.) Hand.-Mazz., 1907 | Pissenlit de Bessarabie |
| Angiospermes | Tephroseris palustris (L.) Fourr., 1868 | Cinéraire des marais, Sénéçon des marais |
| Angiospermes | Teucrium aristatum Pérez Lara, 1889 | Germandrée aristée, Germandrée de Crau |
| Angiospermes | Teucrium aristatum subsp. cravense (Maire, Molin. & G.Tallon) J.-M.Tison, 2010 | |
| Angiospermes | Teucrium fruticans L., 1753 | Germandrée arbustive |
| Angiospermes | Teucrium polium subsp. purpurascens (Benth.) S.Puech, 1976 | Germandrée polium, Germandrée purpurine, Herbe des îles |
| Angiospermes | Teucrium pseudochamaepitys L., 1753 | Germandrée à allure de pin, Germandrée faux petit pin |
| Angiospermes | Thesium humile Vahl, 1794 | Thésium peu élevé, Thésium humble |
| Angiospermes | Trifolium pannonicum Jacq., 1767 | Trèfle de Hongrie |
| Angiospermes | Trisetum gracile (Moris) Boiss., 1844 | Trisète grêle |
| Angiospermes | Tulipa gesneriana L., 1753 | Tulipe de Gesner |
| Angiospermes | Urginea fugax (Moris) Steinh., 1834 | Urginée fugace |
| Angiospermes | Utricularia intermedia Hayne, 1800 | Utriculaire intermédiaire |
| Angiospermes | Verbascum conocarpum subsp. conocarpum Moris, 1828 | Molène à fruits coniques |
| Angiospermes | Verbena supina L., 1753 | Verveine étalée, Verveine étalée sur le sol, Verveine couchée |
| Angiospermes | Veronica longifolia L., 1753 | Véronique à longues feuilles |
| Angiospermes | Vicia argentea Lapeyr., 1813 | Vesce argentée |
| Angiospermes | Vicia cassubica L., 1753 | Vesce de Poméranie, Vesce de Cassubie, Vesce cassubique |
| Angiospermes | Viola arborescens L., 1753 | Violette sous-arbustive, Violette ligneuse |
| Angiospermes | Viola elatior Fr., 1828 | Violette élevée |
| Angiospermes | Viola hispida Lam., 1779 | Violette de Rouen, Pensée de Rouen |
| Angiospermes | Viola persicifolia Schreb., 1771 | Violette à feuilles de pêcher, Petit muguet à deux feuilles |
| Angiospermes | Viola pseudomirabilis H.J.Coste, 1893 | Violette du Larzac |
| Angiospermes | Viola pumila Chaix, 1785 | Petite violette, Violette naine |
| BATRACIENS | Bombina variegata | Sonneur à ventre jaune |
| Bivalves | Margaritifera margaritifera (Linnaeus, 1758) | Mulette perlière, Moule perlière |
| Bivalves | Pseudunio auricularius (Spengler, 1793) | Grande mulette |
| Bivalves | Unio crassus Philipsson, 1788 | Mulette épaisse |
| Crustacés | Astacus astacus (Linnaeus, 1758) | Écrevisse à pattes rouges (L'), Écrevisse à pieds rouges (L'), Écrevisse fluviatile (L'), Écrevisse de rivière (L') |
| Crustacés | Austropotamobius pallipes (Lereboullet, 1858) | Écrevisse à pieds blancs (L'), Écrevisse à pattes blanches (L'), Écrevisse pallipède (L') |
| Crustacés | Austropotamobius torrentium (Schrank, 1803) | Écrevisse des torrents (L'), Écrevisse des pierres (L') |
| Gastéropodes | Bythinella carinulata (Drouët, 1867) | Bythinelle de Dijon |
| Gastéropodes | Bythinella viridis (Poiret, 1801) | Bythinelle des moulins |
| Gastéropodes | Helix ceratina Shuttleworth, 1843 | Hélix de Corse, Escargot de Corse |
| Gastéropodes | Plagigeyeria deformata (Nicolas, 1891) | Hydrobie d'Avignon |
| Gastéropodes | Renea bourguignatiana G. Nevill, 1880 | Aiguillette de Menton |
| Gastéropodes | Truncatellina arcyensis Klemm, 1943 | Maillotin de Bourgogne |
| Gymnospermes | Ephedra distachya subsp. helvetica (C.A.Mey.) Asch. & Graebn., 1897 | |
| INSECTES | Cerambyx cerdo | Grand capricorne |
| Insectes | Coenonympha hero (Linnaeus, 1760) | Mélibée (Le), Moelibée (Le), Fadet de l'Élyme (Le) |
| Insectes | Coenonympha tullia (O.F. Müller, 1764) | Fadet des tourbières (Le), Daphnis (Le) |
| INSECTES | Euphydryas desfontainii | Damier des Knauties |
| Insectes | Euphydryas maturna (Linnaeus, 1758) | Damier du Frêne (Le), Mélitée du Frêne (La), Petit Damier à taches fauves (Le), Maturne (La) |
| Insectes | Lycaena helle deslandesi Hemming, 1932 | |
| Insectes | Lycaena helle magdalenae Guérin, 1959 | |
| INSECTES | Macromia splendens | Cordulie splendide |
| Insectes | Papilio alexanor destelensis Nel & Chauliac, 1983 | |
| Insectes | Parnassius apollo lioranus Fruhstorfer, 1921 | |
| Insectes | Parnassius apollo lozerae Pagenstecher, 1909 | |
| Insectes | Parnassius corybas gazeli Praviel, 1936 | |
| Insectes | Parnassius mnemosyne cassiensis Siépi, 1909 | |
| INSECTES | Phengaris nausithous | Azuré des paluds |
| INSECTES | Phengaris teleius | Azuré de la Sanguisorbe |
| INSECTES | Pieris ergane | Piéride de l’Aethionème |
| Insectes | Prionotropis azami Uvarov, 1923 | Criquet hérisson, Criquet des Grands-Plans |
| Insectes | Prionotropis rhodanica Uvarov, 1923 | Criquet rhodanien, Miramelle des moraines, Criquet marcheur, Criquet pédestre |
| INSECTES | Rosalia alpina | Rosalie des Alpes |
| MAMMIFERES | Galemys pyrenaicus | Desman des Pyrénées |
| MAMMIFERES | Miniopterus schreibersii | Minioptère de Schreibers |
| MAMMIFERES | Myotis escalerai | Murin d’Escalera |
| MAMMIFERES | Myotis punicus | Murin du Maghreb |
| MAMMIFERES | Nyctalus lasiopterus | Grande noctule |
| MAMMIFERES | Nyctalus noctula | Noctule commune |
| MAMMIFERES | Plecotus macrobullaris | Oreillard montagnard |
| Mammifères | Capra pyrenaica Schinz, 1838 | Bouquetin ibérique, Bouquetin d'Espagne |
| MAMMIFERES MARINS | Balaenoptera acutorostrata | Petit rorqual |
| MAMMIFERES MARINS | Balaenoptera bonaerensis | Petit rorqual antarctique |
| MAMMIFERES MARINS | Balaenoptera borealis | Rorqual boréal |
| MAMMIFERES MARINS | Balaenoptera edeni | Rorqual tropical |
| MAMMIFERES MARINS | Balaenoptera musculus | Rorqual bleu |
| MAMMIFERES MARINS | Balaenoptera physalus | Rorqual commun |
| MAMMIFERES MARINS | Berardius arnuxii | Bérardie d'Arnoux |
| MAMMIFERES MARINS | Caperea marginata | Baleine pygmée |
| MAMMIFERES MARINS | Cephalorhynchus commersonii | Dauphin de Commerson |
| MAMMIFERES MARINS | Delphinapterus leucas | Belouga |
| MAMMIFERES MARINS | Delphinus capensis | Dauphin commun à bec long |
| MAMMIFERES MARINS | Delphinus delphis | Dauphin commun à bec court |
| MAMMIFERES MARINS | Dugong dugon | Dugong |
| MAMMIFERES MARINS | Eubalaena australis | Baleine franche australe |
| MAMMIFERES MARINS | Eubalaena glacialis | Baleine franche boréale |
| MAMMIFERES MARINS | Feresa attenuata | Orque naine |
| MAMMIFERES MARINS | Globicephala macrorhynchus | Globicéphale tropical |
| MAMMIFERES MARINS | Globicephala melas | Globicéphale noir |
| MAMMIFERES MARINS | Grampus griseus | Grampus |
| MAMMIFERES MARINS | Hyperoodon ampullatus | Hypérodon boréal |
| MAMMIFERES MARINS | Hyperoodon planifrons | Hypérodon austral |
| MAMMIFERES MARINS | Indopacetus pacificus | Mésoplodon de Longman |
| MAMMIFERES MARINS | Kogia breviceps | Cachalot pygmée |
| MAMMIFERES MARINS | Kogia sima | Cachalot nain |
| MAMMIFERES MARINS | Lagenodelphis hosei | Dauphin de Fraser |
| MAMMIFERES MARINS | Lagenorhynchus acutus | Lagénorhynque à flancs blancs |
| MAMMIFERES MARINS | Lagenorhynchus albirostris | Lagénorhynque à bec blanc |
| MAMMIFERES MARINS | Lagenorhynchus cruciger | Lagénorhynque sablier |
| MAMMIFERES MARINS | Lagenorhynchus obscurus | Lagénorhynque obscur |
| MAMMIFERES MARINS | Lissodelphis peronii | Dauphin aptère austral |
| MAMMIFERES MARINS | Megaptera novaeangliae | Baleine à bosse |
| MAMMIFERES MARINS | Mesoplodon bidens | Mésoplodon de Sowerby |
| MAMMIFERES MARINS | Mesoplodon densirostris | Mésoplodon de Blainville |
| MAMMIFERES MARINS | Mesoplodon europaeus | Mésoplodon de Gervais |
| MAMMIFERES MARINS | Mesoplodon layardii | Mésoplodon de Layard |
| MAMMIFERES MARINS | Mesoplodon mirus | Mésoplodon de True |
| MAMMIFERES MARINS | Orcinus orca | Orque |
| MAMMIFERES MARINS | Peponocephala electra | Péponocéphale |
| MAMMIFERES MARINS | Phocoena dioptrica | Marsouin à lunettes |
| MAMMIFERES MARINS | Physeter macrocephalus | Cachalot macrocéphale |
| MAMMIFERES MARINS | Pseudorca crassidens | Pseudorque |
| MAMMIFERES MARINS | Sotalia guianensis | Costero |
| MAMMIFERES MARINS | Sousa chinensis | Dauphin à bosse indo-pacifique |
| MAMMIFERES MARINS | Stenella attenuata | Dauphin tacheté pantropical |
| MAMMIFERES MARINS | Stenella clymene | Dauphin clymène |
| MAMMIFERES MARINS | Stenella coeruleoalba | Dauphin bleu et blanc |
| MAMMIFERES MARINS | Stenella frontalis | Dauphin tacheté de l'Atlantique |
| MAMMIFERES MARINS | Stenella longirostris | Dauphin à long bec |
| MAMMIFERES MARINS | Steno bredanensis | Sténo |
| MAMMIFERES MARINS | Trichechus manatus | Lamantin d'Amérique |
| MAMMIFERES MARINS | Tursiops aduncus | Grand dauphin indo-pacifique |
| MAMMIFERES MARINS | Ziphius cavirostris | Ziphius |
| Oiseaux | Acanthis flammea (Linnaeus, 1758) | Sizerin flammé |
| Oiseaux | Accipiter gentilis arrigonii (Kleinschmidt, 1903) | Autour des palombes (ssp. de Corse) |
| OISEAUX | Acrocephalus arundinaceus | Rousserolle turdoïde |
| Oiseaux | Acrocephalus melanopogon (Temminck, 1823) | Lusciniole à moustaches |
| Oiseaux | Aquila chrysaetos (Linnaeus, 1758) | Aigle royal |
| OISEAUX | Asio flammeus | Hibou des marais |
| OISEAUX | Botaurus stellaris (Linnaeus, 1758) | Butor étoilé |
| Oiseaux | Calandrella brachydactyla (Leisler, 1814) | Alouette calandrelle |
| OISEAUX | Calonectris borealis | Puffin cendré |
| Oiseaux | Calonectris diomedea (Scopoli, 1769) | Puffin de Scopoli |
| OISEAUX | Cecropis daurica | Hirondelle rousseline |
| OISEAUX | Charadrius alexandrinus Linnaeus, 1758 | Gravelot à collier interrompu |
| OISEAUX | Charadrius hiaticula Linnaeus, 1758 | Grand Gravelot |
| OISEAUX | Chlidonias hybrida | Guifette moustac |
| Oiseaux | Chlidonias niger (Linnaeus, 1758) | Guifette noire |
| OISEAUX | Chroicocephalus genei | Goéland railleur |
| Oiseaux | Ciconia nigra (Linnaeus, 1758) | Cigogne noire |
| Oiseaux | Cygnus columbianus (Ord, 1815) | Cygne de Bewick |
| OISEAUX | Dendrocopos leucotos | Pic à dos blanc |
| OISEAUX | Elanus caeruleus (Desfontaines, 1789) | Elanion blanc |
| Oiseaux | Emberiza hortulana Linnaeus, 1758 | Bruant ortolan |
| Oiseaux | Emberiza schoeniclus (Linnaeus, 1758) | Bruant des roseaux |
| Oiseaux | Emberiza schoeniclus witherbyi Jordans, 1923 | |
| Oiseaux | Galerida theklae (C. L. Brehm, 1858) | Cochevis de Thékla |
| Oiseaux | Gavia immer (Brünnich, 1764) | Plongeon imbrin |
| OISEAUX | Gelochelidon nilotica (Gmelin, 1789) | Sterne hansel |
| Oiseaux | Grus grus (Linnaeus, 1758) | Grue cendrée |
| Oiseaux | Haliaeetus albicilla (Linnaeus, 1758) | Pygargue à queue blanche |
| OISEAUX | Hippolais icterina | Hypolaïs ictérine |
| OISEAUX | Hydrobates pelagicus (Linnaeus, 1758) | Océanite tempête |
| Oiseaux | Hydrobates pelagicus melitensis (Schembri, 1843) | |
| Oiseaux | Lanius excubitor Linnaeus, 1758 | Pie-grièche grise |
| Oiseaux | Lanius meridionalis Temminck, 1820 | Pie-grièche méridionale |
| OISEAUX | Lanius senator | Pie-Grièche à tête rousse |
| Oiseaux | Larus canus Linnaeus, 1758 | Goéland cendré |
| Oiseaux | Locustella luscinioides (Savi, 1824) | Locustelle luscinioïde |
| Oiseaux | Mergus serrator Linnaeus, 1758 | Harle huppé |
| OISEAUX | Milvus milvus (Linnaeus, 1758) | Milan royal |
| Oiseaux | Neophron percnopterus (Linnaeus, 1758) | Vautour percnoptère |
| Oiseaux | Numenius phaeopus (Linnaeus, 1758) | Courlis corlieu |
| Oiseaux | Oenanthe hispanica (Linnaeus, 1758) | Traquet oreillard |
| OISEAUX | Pandion haliaetus (Linnaeus, 1758) | Balbuzard pêcheur |
| Oiseaux | Passer montanus (Linnaeus, 1758) | Moineau friquet |
| OISEAUX | Phoenicopterus roseus | Flamant rose |
| Oiseaux | Phylloscopus ibericus Ticehurst, 1937 | Pouillot ibérique, Pouillot véloce ibérique |
| Oiseaux | Picoides tridactylus (Linnaeus, 1758) | Pic tridactyle |
| Oiseaux | Picus canus Gmelin, 1788 | Pic cendré |
| Oiseaux | Podiceps auritus (Linnaeus, 1758) | Grèbe esclavon |
| Oiseaux | Podiceps grisegena (Boddaert, 1783) | Grèbe jougris |
| OISEAUX | Porphyrio porphyrio (Linnaeus, 1758) | Talève sultane |
| OISEAUX | Porzana porzana (Linnaeus, 1766) | Marouette ponctuée |
| Oiseaux | Pterocles alchata (Linnaeus, 1758) | Ganga cata |
| Oiseaux | Puffinus mauretanicus Lowe, 1921 | Puffin des Baléares |
| Oiseaux | Puffinus puffinus (Brünnich, 1764) | Puffin des Anglais |
| Oiseaux | Puffinus yelkouan (Acerbi, 1827) | Puffin yelkouan |
| Oiseaux | Remiz pendulinus (Linnaeus, 1758) | Rémiz penduline, Mésange rémiz |
| OISEAUX | Rissa tridactyla (Linnaeus, 1758) | Mouette tridactyle |
| OISEAUX | Saxicola rubetra | Tarier des prés |
| Oiseaux | Stercorarius longicaudus Vieillot, 1819 | Labbe à longue queue |
| Oiseaux | Sterna paradisaea Pontoppidan, 1763 | Sterne arctique |
| Oiseaux | Sylvia conspicillata Temminck, 1820 | Fauvette à lunettes |
| Oiseaux | Sylvia undata (Boddaert, 1783) | Fauvette pitchou |
| Oiseaux | Zapornia parva (Scopoli, 1769) | Marouette poussin |
| Oiseaux | Zapornia pusilla (Pallas, 1776) | Marouette de Baillon |
| POISSONS | Alosa alosa | Grande Alose |
| POISSONS | Esox aquitanicus | Brochet aquitain |
| POISSONS | Esox lucius | Brochet commun |
| POISSONS | Lampetra fluviatilis | Lamproie de rivière |
| Poissons | Misgurnus fossilis (Linnaeus, 1758) | Loche d'étang |
| POISSONS | Petromyzon marinus | Lamproie marine |
| POISSONS | Salmo salar | Saumon atlantique |
| POISSONS | Salvelinus alpinus | Omble chevallier |
| POISSONS | Thymallus thymallus | Ombre commun |
| Ptéridophytes | Allosorus hispanicus (Mett.) Christenh., 2012 | Cheilanthès d'Espagne |
| Ptéridophytes | Asplenium cuneifolium Viv., 1806 | Doradille cunéiformes, Asplénium à feuilles en coin, Doradille à feuilles cunéiformes |
| Ptéridophytes | Asplenium lepidum C.Presl, 1836 | Doradille élégante, Doradille pulvérulente, Asplénium écailleux |
| Ptéridophytes | Asplenium seelosii Leyb., 1855 | Doradille de Seelos |
| Ptéridophytes | Asplenium seelosii subsp. glabrum (Litard. & Maire) Rothm., 1937 | Doradille de Seelos glabre, Asplénium glabre |
| Ptéridophytes | Botrychium matricariifolium (A.Braun ex Döll) W.D.J.Koch, 1846 | Botrychium à feuilles de Matricaire, Botryche à feuilles de matricaire |
| Ptéridophytes | Botrychium simplex E.Hitchc., 1823 | Botryche simple, Petit botryche, Petit Botrychium |
| Ptéridophytes | Cosentinia vellea (Aiton) Tod., 1866 | Cosentinia velu, Doradille laineuse |
| Ptéridophytes | Dryopteris cristata (L.) A.Gray, 1848 | Dryoptéris à crêtes |
| Ptéridophytes | Dryopteris pallida (Bory) Maire & Petitm., 1908 | Dryoptéris pâle, Dryoptéris pâlissant |
| Ptéridophytes | Dryopteris tyrrhena Fraser-Jenk. & Reichst., 1975 | Fougère chêne, Fougère chêne tyrrhénienne, Dryoptéris tyrrhénienne |
| Ptéridophytes | Hymenophyllum wilsonii Hook., 1830 | Hyménophyllum de Wilson |
| Ptéridophytes | Isoetes boryana Durieu, 1861 | Isoète de Bory |
| Ptéridophytes | Isoetes echinospora Durieu, 1861 | Isoète à spores spinuleuses |
| Ptéridophytes | Isoetes setacea Lam., 1789 | Isoète grêle, Isoète sétacé |
| Ptéridophytes | Isoetes velata subsp. tenuissima (Boreau) O.Bolòs & Vigo, 1974 | Isoète très ténu |
| Ptéridophytes | Marsilea strigosa Willd., 1810 | Fougère d'eau à poils rudes, Marsilea pubescent, Fougère d'eau à quatre feuilles, Marsilée pubescente, Marsiléa pubescent |
| Ptéridophytes | Matteuccia struthiopteris (L.) Tod., 1866 | Fougère à plumes d'autruche, Matteuccie, Fougère allemande |
| Ptéridophytes | Pilularia minuta Durieu, 1838 | Pilulaire délicate, Pilulaire naine |
| Ptéridophytes | Sceptridium multifidum (S.G.Gmel.) Tagawa, 1940 | Botryche à feuilles de rue, Botryche à feuilles multifides |
| Ptéridophytes | Woodsia ilvensis (L.) R.Br., 1815 | Woodsie d'Elbe, Woodsie de l'île d'Elbe |
| Ptéridophytes | Woodwardia radicans (L.) Sm., 1793 | Woodwardia radicant |
| REPTILES | Caretta caretta | Tortue caouanne |
| REPTILES | Chelonia mydas | Tortue verte |
| REPTILES | Dermochelys coriacea | Tortue luth |
| REPTILES | Eretmochelys imbricata | Tortue imbriquée |
| REPTILES | Lepidochelys kempii | Tortue de Kemp |
| REPTILES | Lepidochelys olivacea | Tortue olivâtre |
| REPTILES | Testudo hermanni | Tortue d’Hermann |